Per salvare i propri archivi e gli oggetti connessi (allegati vari) che comunque dimorano distinti più strade sono aperte:

• Fare le copie dei file con comandi a mano espliciti
• oppure: Backup in EndNote come | File | Save a copy
• oppure: | File |  Compressed library, con varie opzioni:  
  • tutto l'archivio o solo i record selezionati o quelli di un Gruppo o insieme (Set) 
  • salva anche gli attachments che stanno nel *.Data folder
  • spedisce per e-mail

Backup e compressione di un archivio e dei suoi allegati

Non va trascurata l'operazione di recupero, riparazione di un archivio che risulta, o si sospetta, danneggiato: | Tools | Recover Library, farà scegliere quale cercare di recuperare e dove collocare la nuova copia sanata